30 Eylül 1964 tarihinde İzmir’de doğdu. 1988 yılında Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi’nden mezun oldu ve aynı fakültede iç hastalıkları asistanlığına başladı. Asistanlık döneminde, 1991 yılında o zamanki adıyla F.M.G.E.M.S olarak bilinen uluslararası yeterlilik sınavlarını kazandı ve 1992-1993 arasında bir yıl süreyle Londra’da St. Thomas’ Hastanesinin Rayne Enstitüsünde, Lupus Araştırma Merkezinde, Dr Graham Hughes ile birlikte çalıştı. 1994 yılında iç hastalıkları uzmanı oldu ve aynı fakültenin Romatoloji Bilim Dalında 1994-1998 yılları arasında romatoloji yan dal uzmanlığını tamamladı. 1999 yılında doçent oldu. 2002 yılında bir aylığına Amerika'da Philadelphia Thomas Jefferson Üniversitesi Romatoloji bilim dalında misafir öğretim üyesi olarak bulundu. Mayıs 2005’te Profesör ünvanını aldı. Romatoloji Araştırma ve Eğitim Derneği, Türk İç Hastalıkları BOARD Komisyonu ve Uluslararası Behçet Derneği üyesi olan Gökhan Keser, evli ve iki çocuk babasıdır. Özel ilgi alanları Behçet hastalığı, sistemik vaskülitler ve bağ dokusu hastalıklarıdır. SCI kapsamında uluslararası dergilerde yayınlanmış 50 civarında dış yayını vardır.  Halen Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi İç Hastalıkları Kliniği Romatoloji Bilim Dalında öğretim üyesi olarak çalışmaktadır.